Los Complejos en sí mismos no son patológicos, pero se “patologizan” cuando se separan de la personalidad y se consolidan como una pequeña personalidad aparte. El yo vivencia ese estado como una “perdida del alma” o también como una “posesión” frente a la cual no puede hacer nada. El Complejo en sí mismo no es negativo, pues “son manifestaciones normales de la vida”. (Jung, 1950)  

Un Complejo es la imagen de cierta situación psíquica que tiene una fuerte carga emocional y que además es incompatible con la actitud normal de la Conciencia.

La vía regia al Inconsciente Personal, según  Jung, no es el sueño como suponía Freud, sino el Complejo.

Los Complejos interfieren en las intenciones y en la voluntad consciente, producen alteraciones en la memoria y bloquean el flujo de las asociaciones. Aparecen y desaparecen regidos por sus propias leyes, influyen de manera inconsciente y se comportan como entidades autónomas. Producen un conflicto que aparece entre el Yo y el Inconsciente Personal,  en los deseos y las motivaciones que son  ajenas a la voluntad y la razón consciente.

Experimentar un Complejo supone estar ante la presencia de una parte de nuestra Psique que no es asimilada y elaborada adecuadamente. Un Complejo se vuelve patológico cuando se niega, ya que cuanto más se niegue más inconsciente se vuelve. Para Freud el Complejo es una cierta cantidad de energía vinculada a un deseo inconsciente (por ejemplo: “el Complejo de Edipo” y “el Complejo de Electra”). Jung acepta lo expuesto por Freud, pero va aún más lejos ya que para él, un Complejo es un núcleo de energía psíquica que vincula determinadas asociaciones entre sí a través de una tonalidad afectiva. Los Complejos pueden reactivar los niveles más profundos del Inconsciente Personal, activando los Arquetipos del Inconsciente Colectivo.

El Inconsciente Colectivo es la región más profunda de la Psique. Es la fuente de toda la energía psíquica, incluida la Consciencia, y es la parte básica de la Libido. Contiene toda la herencia espiritual de la evolución de la Humanidad, las grandes "imágenes primordiales", y constituye el fundamento anímico de naturaleza suprapersonal existente en todo Hombre. Es el Inconsciente "objetivo" al contener la misma información heredada para todos los sujetos, frente al Inconsciente Personal que es de tipo "subjetivo" al contener las experiencias y deseos personales de la vida particular de cada uno .El Inconsciente Colectivo es una imagen histórica especular del mundo y es también en cierta manera un mundo, pero un mundo de imágenes. Los contenidos del Inconsciente Colectivo son los Arquetipos. El Arquetipo es en primer lugar, una epifanía, es decir, la aparición de lo latente a través de la visión, el sueño, la fantasía y el mito. Todas estas manifestaciones según Jung (1920) son frutos de la vida interior en perpetuo fluir des de las profundidades, en un proceso parecido al de la creación en su gradual desarrollo. Si la creación determina el surgimiento de seres y objetos, la energía de la psique se manifiesta a través de la imagen, entidad que está entre lo informal y  lo conceptual, entre lo que es  tenebroso y lo que es luminoso, entre la ambivalencia y la paradoja. Jung (1920) utiliza la palabra Arquetipo para referirse a aquellos símbolos universales que revelan la máxima constancia y eficacia, la más gran virtualidad respecto a la evolución anímica, que conduce de lo  inferior a lo superior. Pero también los relaciona con la estructura de la psique: “ Los Arquetipos son elementos estructurales numinosos de la psique y poseen cierta autonomía y energía específica, en virtud de la cual pueden atraer los contenidos de la conciencia que les convengan”. Y después añade: “No se trata de representaciones heredadas, sino de cierta predisposición innata en la formación de representaciones paralelas que denominé “Inconsciente Colectivo”. Llamé Arquetipos a estas estructuras que corresponden al concepto biológico de “pautas de comportamiento” (Pág. 47). Y continua: “Hay un reino intermedio entre la unidad del alma individual y su soledad y la multiplicidad Universo............y este reino es la representación del mundo en el alma y del alma en el mundo, es decir, el lugar de lo  simbólico que funciona en les vías preparadas de los Arquetipos que son presencias eternas, siendo el problema dilucidar si la conciencia los  percibe o no" (Pág.62).Por tanto el Arquetipo tiene una doble función, por una parte seria el creador de les imágenes simbólicas y por otra parte son los elementos estructurales numinosos del Inconsciente Colectivo. En este sentido son incognoscibles porqué en esencia están más allá del espacio y el tiempo. Nuestra consciencia se  mueve en parámetros espacio – tiempo, por tanto no puede entender lo que se mueve fuera de estos parámetros.

Jung define la esencia del Arquetipo diciendo que son sistemas disponibles de imágenes y emociones a la vez, son heredados con la estructura cerebral y son su  aspecto psíquico.Toma la expresión de Sant Agustín, que lo utiliza en un sentido muy próximo al de Platón y su concepto de Idea, es decir, la realidad primordial de la que surgen  como ecos i desdoblamientos, les realidades existenciales. El significado de los Arquetipos solo es parcialmente accesible, permaneciendo secreta su identidad más profunda, porqué son anteriores al hombre y se proyecten más allá de el.